「開業して数年たったし、そろそろ医療法人化を考えた方がいいのかな？」
個人クリニックの先生からよく聞かれるテーマです。

この記事では、検索ニーズの高い
「個人クリニック　法人化　メリット　デメリット」
をしっかり押さえつつ、

• そもそも医療法人化とは何か

• どんなメリット・デメリットがあるのか

• どのくらい稼いでいたら法人化を検討すべきか（目安）

を、できるだけ実務寄りに整理します。

１．個人クリニックの「法人化（医療法人化）」とは？

ここでいう法人化は、
個人開業医としてのクリニックを「医療法人」に切り替えることを指します。

医療法人は、医療法に基づく「特別な法人」で、

• 都道府県知事の認可が必要

• 理事長・理事・監事などの役員で運営

• 診療所だけでなく、介護施設なども運営できる

といった特徴があります。

※この記事では、一般的なケースが多い医療法人社団を前提に話を進めます。

２．個人クリニックが法人化（医療法人化）する４つのメリット

① 税金面のメリット（節税・所得分散）

個人事業のままだと、利益は院長個人の「事業所得」として課税され、
所得が増えるほど税率が上がる超過累進課税が適用されます（最高税率55％）。

一方、医療法人にすると

• 法人税率は原則 15％（年800万円以下）と23.2％（超過部分）

• 院長や家族に役員報酬として支払うことで「所得分散」ができる

• 給与には給与所得控除が使える

ため、一定以上の所得がある先生はトータルの税負担を下げられる可能性が高いです。

② 信用力アップと資金調達のしやすさ

医療法人化には都道府県知事の認可が必要で、財産や運営体制の審査も入ります。
そのため、

• 一般の個人クリニックより社会的信用が高いと評価されやすい

• 銀行からの融資・リースが通りやすくなる

といった効果が期待できます。

新規設備投資や分院展開を考えている先生ほど、
この信用力アップは大きな武器になります。

③ 事業承継・相続対策になる

個人開業のままでは、
院長が亡くなったり引退するときに

• 医院の資産に相続税がかかる

• 子や後継医師への承継で手続きが煩雑

という問題が出ます。

医療法人化しておけば、

• 理事長の交代手続きでスムーズに事業承継しやすい

• 出資持分なしの医療法人なら、相続税の負担を抑えられる

など、承継面で大きなメリットがあります。

④ 人材採用・定着に有利（福利厚生の整備）

医療法人は原則として

• 社会保険（健康保険・厚生年金）への加入が義務

• 退職金制度や福利厚生制度を整えやすい

といった特徴があるため、

• 優秀なスタッフを採用しやすい

• 長く働いてもらう前提での人材定着がしやすい

というプラス面があります。

「スタッフがすぐ辞めてしまう」「採用に苦戦している」
というクリニックほど、法人化の恩恵を受けやすいです。

３．個人クリニックが法人化する５つのデメリット

① 設立コスト・維持コストが増える

医療法人化には、

• 定款作成・認可申請・登記などの初期コスト

• 税理士・社労士・行政書士など専門家への報酬

• 毎年の決算報告・事業報告書提出などのランニングコスト

が発生します。

「税金は減ったけど、専門家報酬と手続きコストでトータル黒字が薄くなった」
というパターンもあるので要注意です。

② 事務負担・ガバナンス義務が重くなる

医療法人になると、

• 事業報告書や計算書類を毎事業年度提出

• 理事会・社員総会の開催（議事録作成）

• 都道府県による立ち入り検査・指導

など、情報開示・ガバナンス関連の事務が増加します。

「診療に集中したいのに、書類ばかり増える……」と感じる先生は多いです。

③ 個人のお金の出し入れが自由にできない

個人クリニック時代は、

• クリニックの口座から個人の生活費を引き出す

• プライベートな支出も事業主勘定で処理

といった運用をしているケースもありますよね。

しかし医療法人になると、

• 法人のお金と個人のお金は厳格に区分

• 法人から院長個人への貸付は原則NG（行政指導上）

となるため、「自由に使えるお金」が減ったように感じることがあります。

④ 社会保険料負担の増加

個人クリニックでは、スタッフが5人未満なら
必ずしも厚生年金・健康保険に加入義務はありませんが、

医療法人にすると、原則として役員・従業員とも社会保険に加入義務が生じます。

給与の約30％前後が社会保険料で、その半分は法人負担です。
人件費が確実に増える点はデメリットとして押さえておく必要があります。

⑤ 医療法人特有の制約（事業範囲・残余財産など）

医療法人には、

• 医療・介護等の付帯業務以外の営利事業は原則不可

• 解散時の残余財産は、国・自治体などに帰属させるのが一般的

といった制度上の制約があります。

「将来、自由なビジネス展開をしたい」「最終的な財産を自分のものにしたい」
という価値観だと、仕組みの硬さをデメリットに感じやすいです。

４．「法人化すべきか」のざっくり目安（タイミング）

税務・経営の専門家の解説をまとめると、
医療法人化を検討し始める典型的なタイミングは次のとおりです。

目安１：年間事業所得が1,800万円を超えた頃

• 個人事業の所得が1,800万円を超えると、所得税と住民税を合わせた実効税率が40％以上になり、税負担がかなり重くなります。

• この辺りから、法人税＋役員報酬による所得分散を組み合わせた方が、トータルで有利になるケースが多いとされています。

目安２：社会保険診療報酬が5,000万円を超えた頃

個人事業では「概算経費」という特例により、
社会保険診療報酬に対する経費を多めに認めてもらえる制度がありますが、
年間5,000万円を超えるとこの特例が使えなくなります。

そのため、

• 社保診療報酬が5,000万円を超えてきた

• 自由診療も含めると7,000万円以上ある

クリニックは、医療法人化による節税余地が大きくなりやすいとされています。

目安３：分院展開・事業拡大・事業承継を本気で考え始めたとき

• 分院や介護事業など、複数施設を運営したい

• 将来、子どもや若手医師にスムーズに承継したい

といったニーズが出てきたタイミングも、
医療法人化を検討する大きなポイントです。

５．あえて「個人クリニックのまま」にしておくメリット

法人化がブームのように語られることもありますが、
あえて個人のままの方がラクなケースもあります。

• 開設・運営に関する義務が比較的少なく、フットワークが軽い

• 所得がそれほど高くないうちは、所得税率も低く、節税メリットが小さい

• 事務作業やガバナンスより、診療に集中したい

• 将来の分院展開や大きな事業承継は考えていない

こういったクリニックは、
法人化コスト・手間＞メリットになりやすいので、
無理に医療法人化する必要はありません。

６．まとめ：法人化は「税金だけ」で決めない

最後に、ポイントを整理します。

• 個人のクリニックが法人化（医療法人化）する主なメリット

• 節税・所得分散

• 信用力アップと資金調達のしやすさ

• 事業承継・相続対策

• 人材採用・定着のしやすさ

• デメリット

• 設立・維持コストが増える

• 事務負担・ガバナンス義務の増加

• 個人のお金を自由に動かしにくくなる

• 社会保険料負担の増加

• 事業範囲や残余財産など、制度上の制約

• 検討の目安

• 年間事業所得が 1,800万円超

• 社会保険診療報酬が 5,000万円超

• 分院・事業拡大・事業承継を本気で考え始めたタイミング

結論：
医療法人化は「節税」はもちろん、事業承継・人材・信用力まで含めた総合判断です。

数字のシミュレーションだけでなく、

• 今後どれくらい働くつもりか

• クリニックをどこまで大きくしたいか

• 家族や後継者にどう引き継ぎたいか

まで含めて、税理士・社労士・行政書士など専門家と一度じっくり相談してから決めるのがおすすめです。